Статтею 65 Водного кодексу визначено, що користування водами для потреб сільського господарства здійснюється у порядку як загального, так і спеціального водокористування.
Зрошення сільськогосподарських угідь стічними водами може бути дозволено державними органами охорони навколишнього природного середовища за погодженням з державними органами санітарного і ветеринарного нагляду.
Зрошення сільськогосподарських угідь та скидання дренажних вод у водні об'єкти здійснюються на підставі дозволу на спеціальне водокористування, який видається власнику зрошуваних угідь у порядку, встановленому Водним кодексом. Дозвіл на спеціальне водокористування видається державними органами охорони навколишнього природного середовища у разі використання води водних об'єктів загальнодержавного значення та Верховною радою Автономної Республіки Крим, обласними, Київською та Севастопольською міськими радами за погодженням з державними органами охорони навколишнього природного середовища — у разі використання води водних об'єктів місцевого значення.
Порядком № 1494 визначено, що збір за спеціальне використання водних ресурсів справляється за використання води з водних об'єктів, яка забрана із застосуванням споруд або технічних пристроїв, та скидання в них зворотних вод.
Платниками збору за спеціальне використання водних ресурсів та збору за користування водами для потреб гідроенергетики і водного транспорту є підприємства, установи та організації незалежно від форми власності, а також громадяни — суб'єкти підприємницької діяльності, що використовують водні ресурси та користуються водами для потреб гідроенергетики і водного транспорту (п. 3 Порядку № 1494).
Водночас у п. 16 Порядку № 1494 зазначено, що збір за використання водних ресурсів не справляється, зокрема за воду, втрачену в магістральних і міжгосподарських каналах зрошувальних систем.
Отже, власник зрошувальних систем є водокористувачем і за обсяги води, використаної для зрошування угідь (за наявності відповідного дозволу на спеціальне водокористування, який видається власнику), повинен сплачувати збір за спеціальне використання водних ресурсів.